การติดตามตรวจสอบคุณภาพน้ำแหล่งน้ำผิวดินที่สำคัญทั่วประเทศจากแม่น้ำสายหลักของประเทศ 61 แหล่งน้ำ และแหล่งน้ำนิ่ง 9 แหล่ง ใน พ.ศ. 2565 พบว่า มีแหล่งน้ำที่มีดัชนีคุณภาพน้ำในแหล่งน้ำผิวดิน (Water Quality Index: WQI) ส่วนใหญ่อยู่ในเกณฑ์ดี ร้อยละ 43 รองลงมา คือ เกณฑ์พอใช้ ร้อยละ 41 และเกณฑ์เสื่อมโทรม ร้อยละ 16 ตามลำดับ ซึ่งแหล่งน้ำที่มีคุณภาพอยู่ในเกณฑ์ดีมาโดยตลอด ได้แก่ หนองหารแม่น้ำตาปีตอนบน แควน้อย และสงคราม เกณฑ์ดีและพอใช้ ได้แก่ แม่น้ำเจ้าพระยาตอนบน ปราจีนบุรี บางปะกง แม่กลอง แควใหญ่ จันทบุรี เวฬุ ตราด กก ปิง น่าน ลี้ ยม วัง อิง แม่จาง อูน ชี มูล ลำตะคองตอนบน ลำชี เสียว เลย ตาปีตอนล่าง พุมดวง ปากพนัง เพชรบุรีตอนบน ปราณบุรี หลังสวนตอนล่าง หลังสวนตอนบน กุยบุรี ทะเลหลวง ทะเลสาบสงขลา ตรัง สายบุรี ปัตตานีตอนล่าง และปัตตานีตอนบน เกณฑ์เสื่อมโทรมอย่างต่อเนื่องและยังคงต้องเฝ้าระวังและดำเนินการแก้ไขปัญหา ได้แก่ แม่น้ำเจ้าพระยาตอนล่าง ท่าจีนตอนล่าง ลพบุรี ระยองตอนล่าง พังราดตอนบน กวง และลำตะคองตอนล่าง แหล่งน้ำโดยรวมมีคุณภาพน้ำดีขึ้นจาก พ.ศ. 2564 เมื่อพิจารณาในช่วง 10 ปีที่ผ่านมา พบว่า คุณภาพน้ำแหล่งน้ำผิวดินมีแนวโน้มดีขึ้นเล็กน้อย และคุณภาพน้ำของแหล่งน้ำส่วนใหญ่อยู่ในเกณฑ์พอใช้ถึงดี ไม่มีแหล่งน้ำที่อยู่ในเกณฑ์เสื่อมโทรมมาก